что показывает пцр кала
Что показывает пцр кала
Анализы на острые кишечные инфекции
Возбудители острых кишечных инфекций — это бактерии, вирусы и простейшие из различных таксономических групп. Чтобы быстро выявить возбудителей ОКИ, существуют специальные анализы на острые кишечные инфекции, которые включают в себя исследования ( ) и (антигенные тесты идентификации возбудителей ОКИ).
Данные методы позволяют диагностировать ОКИ на ранних стадиях заболевания и при приеме антибиотиков. В качестве вспомогательных анализов на острые кишечные инфекции используются серологические методы, позволяющие обнаружить специфические антитела к возбудителям.
ПЦР кала: что это такое?
Среди анализов на острые кишечные инфекции особое место занимает кала, которую еще называют ПЦР. В настоящее время это один из самых точных методов определения острых кишечных инфекций, который апробирован клинически и проверен временем.
Итак, ПЦР кала: что это такое? Полимеразная цепная реакция является экспериментальным методом молекулярной биологии. Даже если в пробе присутствует всего несколько молекул ДНК возбудителя болезни, способ значительного увеличения малых концентраций определенных фрагментов нуклеиновой кислоты (ДНК) сможет их определить.
Преимущества ПЦР кала при определении инфекционных заболеваний следующие:
Правила сбора кала для анализа
Чтобы результат анализа был максимально точным, нужно соблюдать определенные правила сбора кала. Рекомендуется за несколько дней до сдачи прекратить прием слабительных препаратов, ректальных свечей, масел и препаратов, которые могут повлиять на окраску кала.
Биоматериал собирают в специальные стерильные контейнеры, которые нельзя ополаскивать или протирать. При сборе материала нельзя трогать руками внутреннюю поверхность контейнера, и собирать его нужно специально предназначенной для этого палочкой, заполняя контейнер не более чем на 1/3. Необходимо внимательно следить, чтобы в биоматериал не попали другие биологические жидкости, например моча.
Анализ кала на острые кишечные инфекции в Центре лабораторных технологий «АБВ»
В Центре лабораторных технологий «АБВ» анализ кала на острые кишечные инфекции проводится методом восьми бактериальных и вирусных возбудителей острых кишечных инфекций в кале и определения РНК энтеровирусов. Вы можете сдать анализ в ближайшем к вам офисе Центра лабораторных технологий — звоните по телефонам и и узнавайте цену анализов и расписание приема.
Звоните:
тел. (звонок бесплатный),
.
Центр лабораторных технологий «АБВ» оснащен новейшим автоматизированным оборудованием, позволяющим проводить широкий спектр общеклинических, биохимических и других анализов. У нас проводятся гематологические, иммунологические, гормональные, коагулогические, цитологические, микробиологические и другие лабораторные исследования, полный перечень которых представлен в левом меню.
Использование в работе высокотехнологичного оборудования из США, Японии, Швейцарии, Франции, Германии, многоуровневый контроль качества проведенных исследований, богатый накопленный опыт сотрудников – все это позволяет нам сохранять высокий стандарт лабораторной диагностики, гарантируя вам получение достоверных результатов в кратчайшие сроки!
Лаборатория центра работает с понедельника по пятницу с 07.30 до 18.00, в субботу с 08.00 до 13.00, воскресенье – выходной.
Острые кишечные инфекции методом ПЦР, скрининг (Shigella spp., E. coli (EIEC), Salmonella spp., Campylobacter spp., Adenovirus F, Rotavirus A, Norovirus 2 генотип, Astrovirus)
Описание
Острые кишечные инфекции (ОКИ) – это целая группа заболеваний различной этиологии (бактерии, вирусы, простейшие), для которых характерен фекально-оральный механизм передачи. Источником заражения может быть пища, вода, грязные руки, инфицированные предметы быта. Для большинства ОКИ характерно довольно тяжелое течение с диареей, болью в животе, выраженной интоксикацией, особенно в детском возрасте.
Показания
Боли в животе, жидкий стул, урчание в животе (слышное на расстоянии), вздутие живота, боли вокруг пупка (усиливающиеся при дефекации), диарея. Исследование проводится для диагностики, а также дифференциальной диагностики острых форм кишечных инфекций, носительства, при обследовании контактных лиц, а также для оценки эффективности проведенного лечения.
Во время проведения скрининга идентифицируются:
Shigella spp. – грамотрицательные палочковидные микроорганизмы из семейства энтеробактерий. К роду Shigella относятся патогенные бактерии, которые являются возбудителями шигеллеза (бактериальной дизентерии).
E. coli (EIEC) – Escherichia coli, общепринятое сокращение E. сoli, (EIEC-энтеровазивные) очень близки с шигеллами, синтезируют и выделяют шигеллоподобный токсин, способны проникать в клетки слизистой кишечника и повреждать энтероциты, что приводит к образованию язвенных дефектов в слизистый кишечник.
Salmonella spp. – относятся к семейству энтеробактерий. Существует множество серовариантов Salmonella species, способных вызвать у человека инфекцию по типу гастроэнтероколита, может протекать в форме острой кишечной инфекции, тяжелой генерализированной инфекции или бессимптомного носительства. Диагноз ставится только после выделения возбудителя, в данном исследовании после обнаружения его ДНК.
Campylobacter spp. В настоящее время кампилобактер рассматривается как ведущая причина бактериального гастроэнтерита у населения во всем мире. Молекулярно-генетический анализ для определения группы кампилобактерий позволяет детектировать те виды кампилобактерий, которые имеют этиологическую связь с острой кишечной инфекцией.
Adenovirus F – Аденовирусы группы F причина частых случаев вирусного гастроэнтерита. Наиболее часто аденовирусная кишечная инфекция наблюдается у детей в возрасте до 2 лет, однако также могут болеть подростки и взрослые люди. Молекулярно-генетический анализ аденовируса группы F обладает высокой диагностической чувствительностью и специфичностью.
Rotavirus A – ротавирусы А возбудители острой инфекции, при которой поражаются органы желудочно-кишечного тракта, сопровождается диареей, из-за которой возникает риск обезвоживания, нарушения электролитного и кислотно-щелочного баланса. Чаще гастроэнтеритом заболевают дети до 3 лет, у которых ротавирус составляет до 50% всех зарегистрированных случаев кишечных инфекций.
Norovirus 2 генотип – наиболее частый возбудитель вспышек ОКИ небактериальной этиологии. Эта особенность связана с низкой инфицирующей дозой и высокой устойчивостью в окружающей среде. ПЦР является «золотым стандартом» в клинической диагностике норовирусных инфекций.
Astrovirus – возбудитель острой кишечной инфекции. Астровирусная инфекция в большей степени поражает детей до 7 лет, причем наиболее часто заболевание наблюдаются у детей до года.При атаке вирусом поражается эпителий кишечника и Пейеровы бляшки. При этом развивается энтерит, сопровождающийся поносом и обезвоживанием организма.
Подготовка
Исследование рекомендуется проводить до начала приема либо спустя 14 дней после приёма антибиотиков и других антибактериальных химиотерапевтических препаратов. Исключается прием слабительных препаратов, введение ректальных свечей, масел в течение 72 часов до сбора кала.
Сбор материала
Кал собирается после самопроизвольной дефекации в одноразовый пластиковый контейнер с герметичной крышкой и ложечкой-шпателем для отбора пробы. Следует избегать примеси к калу мочи и отделяемого половых органов.
Кал собирается в количестве не более 1/3 объёма контейнера, в объеме не менее 5 г (половина чайной ложки). Хранение при температуре +2+8 С. Материал необходимо доставить в медицинский офис в течение 24 часов.
Анализ кала на ПЦР
По анализу кала можно заподозрить множество патологий, связанных с пищеварительной системой и не только. Опираясь на полученные данные, врач назначает соответствующее лечение. Анализ кала на ПЦР один из наиболее информативных способов получения информации о состоянии здоровья пациента.
Анализ кала на ПЦР позволяет определить с высокой степенью точности большую часть микроорганизмов, обитающих в кишечнике, как патогенных, так и условно-патогенных. Этот отдел пищеварительной системы наиболее заселен бактериями, вирусами, простейшими.
Показания к анализу
Причин, по которым может потребоваться анализ кала на ПЦР достаточно много. Это и некоторые виды наследственных заболеваний, и наличие кишечных инфекций и последствия приема некоторых медикаментозных средств, соблюдение диет, отрицательно влияющих на организм, наличие вредных привычек.
Все эти факторы создают условия для возникновения различных видов заболевания кишечника, в том числе и сопровождающихся нарушением микрофлоры. В этом случае полезные микроорганизмы вытесняются заменяющей их патогенной флорой.
Данный тип обследования врачи назначают пациентам, которые жалуются на:
Помимо этого, может повышаться температура, появляться сыпь на кожных покровах, или будет изменяться оттенок кожи и склер глазных яблок.
Все эти симптомы являются общими для многих кишечных заболеваний. Например, боли в животе при разных кишечных заболеваниях всегда присутствуют, но носят различный характер, локализацию и время возникновения, поэтому без анализа кала не обойтись при постановке диагноза, иначе вероятность ошибки будет высока.
Подготовка к процедуре
К сдаче кала необходимо соответствующим образом подготовиться.
Наиболее информативными будут те фрагменты кала где будут посторонние включения, имеется кровь и слизь.
Причины ложных результатов
Не всегда полученные результаты будут отражать истинную картину процессов, происходящих в кишечнике. Это происходит в следующих случаях:
Положительное значение может быть получено по вине лаборанта, в материал попадет ДНК микроорганизмов, оставшееся после предыдущего материала.
Изменение полученных данных может произойти, если будут использованы просроченные реагенты.
Как проводится анализ
Используя метод ПЦР, в кале можно выявить хеликобактер пилори, лямблии, присутствие простейших, грибов и глистов. Данный способ выявления инфекций существует не так давно, около тридцати лет. В его основу положена способность обнаружения в материале участков ДНК возбудителей.
Для этого структуры образца многократно увеличивают с помощью создания специальных условий, при которых из одной молекулы ДНК получается две. На образование одной цепочки уходит до трех минут. После того как образуется достаточно число молекул, проводят их визуальное опознание.
Нормы и расшифровка результата
В ходе исследования проводится прямое определение возбудителя, в то время как другие виды диагностики имеют дело лишь с продуктами их жизнедеятельности, которые только косвенно свидетельствуют о присутствии патогенного микроорганизма.
ПЦР анализ имеет высокий уровень специфичности, так как каждый организм имеет ДНК, свойственное только его виду. Исследование обладает высокой степенью чувствительности, так как позволяет найти даже единичные клетки возбудителя в материале.
Так как РНК И ДНК у организмов состоят из одинаковых наборов белков, то подобный принцип исследования универсален и обнаруживает практически все виды возбудителей.
С помощью ПЦР метода удается определить микроорганизмы, которые не поддаются культивации и поэтому не идентифицируются с помощью других, уже ставших традиционными методов.
У этого метода существуют и недостатки. С его помощью невозможно изучать возбудителей, чьё ДНК еще не было обнаружено и исследовано. Так как возбудители под действием различных факторов часто мутируют, результат анализ становится ложноположительным.
ПЦР-диагностика ОКИ (острые кишечные инфекции)
Комплексное молекулярно-генетическое исследование, которое позволяет выявить генетический материал наиболее вероятных возбудителей острых кишечных инфекций в кале и установить этиологию заболевания.
Полимеразная цепная реакция в режиме реального времени.
Какой биоматериал можно использовать для исследования?
Как правильно подготовиться к исследованию?
Общая информация об исследовании
Острые кишечные инфекции (ОКИ) – группа заболеваний, обусловленных вирусами, бактериями или паразитами, для которых характерен фекально-оральный механизм передачи. Общими для данных инфекций являются факторы передачи: пищевые продукты, вода, инфицированные бытовые предметы и грязные руки. Первые симптомы возникают через несколько часов или дней после инфицирования, начало резкое, с появлением частого жидкого стула, рвоты, боли в животе, признаков интоксикации (лихорадки, озноба, тошноты). Заболевание может носить групповой характер и проявиться у нескольких человек, употреблявших инфицированную пищу или воду.
Согласно официальной статистике, в России до 65-67% заболеваний этой группы составляют ОКИ неуточненной этиологии. Если возбудитель инфекции неизвестен, эффективность противоэпидемических мероприятий ограничивается. Соотношение частоты выявления вирусных и бактериальных патогенов варьируется в разных возрастах: у детей до 3 лет на долю вирусных агентов приходится 80-90% заболеваний, на долю бактериальных – 10-20%; среди взрослых пациентов доля вирусных возбудителей снижается до 30%.
Shigella species и Esherichia coli – грамотрицательные палочковидные микроорганизмы из семейства энтеробактерий.
К роду Shigella относятся патогенные бактерии S. dysenteriae, S. flexneri, S. boydii и S. sonnei, которые являются возбудителями шигеллеза (бактериальной дизентерии).
Энтероинвазивные E. coli (EIEC) очень близки с шигеллами, синтезируют и выделяют шигеллоподобный токсин, способны проникать в клетки слизистой кишечника и разрушать энтероциты, что приводит к образованию язвенных дефектов в слизистой кишечника. За значительную часть случаев «бактериологически неподтвержденной дизентерии», особенно у детей, ответственен энтероинвазивный эшерихиоз.
Бактерии рода Salmonella относятся к семейству энтеробактерий. S. typhi и S. parathyphi являются возбудителями брюшного тифа и паратифа. Существует множество серовариантов Salmonella species, способных вызвать у человека инфекцию по типу гастроэнтероколита, а также стать причиной внутрибольничных инфекций. Сальмонеллез может протекать в форме острой кишечной инфекции, тяжелой генерализированной инфекции или бессимптомного носительства. Окончательный диагноз ставится только после выделения возбудителя или обнаружения его ДНК.
Кампилобактерии являются одними из наиболее сложных для культивирования (которое требуется в ходе анализа) микроорганизмов. Это объясняется их микроаэрофильностью и возможностью подавления их роста сопутствующей флорой. Род кампилобактерий объединяет как возбудителей ОКИ (термофильные виды), так и сапрофитные и условно-патогенные виды, о чем необходимо помнить при выявлении этих микроорганизмов в клиническом материале. Применение наборов на основе ПЦР для определения термофильной группы кампилобактерий позволяет не только избежать трудоемкой и высокозатратной бактериологической работы, но и четко ограничить детекцию тех видов кампилобактерий, которые имеют этиологическую связь с острой кишечной инфекцией (С. jejuni, C. coli, C. lari, C. upsaliensis).
В соответствии с данными зарубежной литературы, норовирус – наиболее частый возбудитель вспышек ОКИ небактериальной этиологии. Эта особенность связана с низкой инфицирующей дозой и высокой устойчивостью в окружающей среде. ПЦР является «золотым стандартом» в клинической диагностике норовирусных инфекций.
Несмотря на несколько меньшую в сравнении с рота- и норовирусами распространенность, астровирусы составляют значительный пласт кишечных инфекций, у трети пациентов протекающий с явлениями колита.
Ротавирусы группы А являются наиболее частой причиной спорадических заболеваний ОКИ у детей, а ДНК-содержащий аденовирус F (серотипы 40 и 41) нередко вызывает вспышки гастроэнтеритов у детей младшего возраста.
Для выявления и дифференциальной диагностики кишечных инфекций используются культуральные и молекулярно-генетические методы исследования генетического материала возбудителя в кале и определение концентрации специфических иммуноглобулинов в крови. ПЦР обладает преимуществом перед культуральными методами благодаря быстрому получению результатов, высокой специфичности и чувствительности исследования. Данный анализ позволяет со 100-процентной точностью определить возбудителя кишечного заболевания, а быстрая диагностика острых кишечных инфекций помогает избежать лишних процедур и оперативных вмешательств, своевременно начать лечение и ограничить очаг распространения инфекции.
Для чего используется исследование?
Когда назначается исследование?
Что означают результаты?
Референсные значения: отрицательно.
Причины положительного результата:
Причины отрицательного результата:
Что может влиять на результат?
Факторы, искажающие результат:
Хеликобактер, ДНК (Helicobacter pylori, ПЦР) кал, кач. в Москве
Приём и исследование биоматериала
Когда нужно сдавать анализ Хеликобактер, ДНК (Helicobacter pylori, ПЦР) кал, кач.?
Подробное описание исследования
Исследование позволяет определить ДНК Helicobacter pylori. Проводится методом полимеразной цепной реакции (ПЦР) в режиме реального времени. Используется для дифференциальной диагностики заболеваний, вызываемых Helicobacter pylori.
H. pylori — грамотрицательная бактерия спиралевидной формы, активно функционирующая в кислой среде желудка. Возбудитель продуцирует аммиак, который делает его устойчивым к желудочному соку и позволяет разрушать слизистый барьер, что в последующем приводит к ульцерогенезу. Хеликобактерная инфекция ассоциирована с такими патологиями желудочно-кишечного тракта, как гастрит, язвенная болезнь желудка и двенадцатиперстной кишки, аденокарцинома и недифференцируемая лимфома желудка.
Инфицирование Helicobacter pylori является основной причиной хронического гастрита и язвенной болезни; также эпидемиологические исследования, проведенные в последние годы, подтвердили связь персистирующей инфекции с повышенным риском возникновения рака желудка. Кроме того, эта бактерия является причиной большинства случаев лимфомы (формы онкогематологических заболеваний, характеризующихся пролиферацией клеток лимфоидной ткани, связанной со слизистой оболочкой пищеварительного тракта). Установлено, что инфекция довольно широко распространена и среди очень молодых возрастных групп (детей и подростков). Основным резервуаром инфекции являются Н. pylori-положительные лица и внутрисемейные контакты между членами семьи являются наиболее важным путем передачи, в основном, в раннем детстве.
В развивающихся странах могут случаться и другие пути передачи, например, через воду. Инфекция развивается, во многих случаях, протекая бессимптомно. В случае появления сопутствующих клинических симптомов у пациентов обычно наблюдаются диспептические симптомы с дискомфортом и болью в животе, тошнотой, изжогой, отрыжкой, чувством полноты после еды. Выявление H. pylori IgG антител является стандартным инструментом для исследования эпидемиологии инфекции. Тест используется для скрининга бессимптомных лиц из семей больных с заболеваниями, связанными с инфекцией H. pylori.
Путь передачи инфекции — алиментарный.
Инфекция может как протекать бессимптомно, так и вызывать диспепсические расстройства различной выраженности. Имеется зависимость от локализации возбудителя: